В Украине Шепелев подозревается в совершении ряда преступлений, таких как организация умышленного убийства, покушения на убийство, присвоение и растрата чужого имущества путем злоупотребления служебным положением.
Его супруга, в свою очередь, подозревается в завладении денежными средствами АО «Родовид Банк» под предлогом фиктивной аренды банком нежилого помещения.